বাংলাদেশ হচ্ছে মন্ত্রিপরিষদ শাসিত সরকার। প্রধানমন্ত্রী মন্ত্রিপরিষদের প্রধান হলেও, মন্ত্রিপরিষদের প্রধান নির্বাহী হচ্ছেন মন্ত্রিপরিষদ সচিব। দেশের নীতিনির্ধারণী পর্যায়ের অন্যতম একজন অংশ হলেন তিনি। তাই তার অনেক ক্ষমতাও আছে। তিনি যেকোনো সরকারি কর্মকর্তাকে চাকরি থেকে বহিষ্কার করার ক্ষমতা রাখেন। তার কার্যক্রমগুলি হচ্ছেঃ-
১. প্রধানমন্ত্রীর প্রধান উপদেষ্টা হিসেবে কাজ করেন।
২. মন্ত্রীপরিষদ বিভাগের মধ্যে সমন্বয় সাধন করেন।
৩. সরকারের সবগুলো মন্ত্রণালয়ের মধ্যে সমন্বয় করেন।
৪. সুপিরিয়র সিলেকশন বোর্ডের প্রধান হিসেবে কাজ করেন।
৫. সচিব কমিটির প্রধান হিসেবে কাজ করেন।
৬. বাংলাদেশ আডমিনিস্ট্রেটিভ সার্ভিসের প্রধান হিসেবে কাজ করেন এবং বাংলাদেশ সিভিল সার্ভিসের প্রধানও তিনিই।
তাই এটা সহজেই বলা চলে যে, মন্ত্রিপরিষদ সচিব নিজেও অনেক ক্ষমতা রাখেন।